Terdapat banyak sekali subspesies Rusa Sika:

• Rusa Sika Honshu Utara, C. n. aplodontus, terdapat di Honshu Utara
• Rusa Sika Dybowski, C. n. dybowskii, Timur Jauh Rusia, adakalanya dikira sama subspesiesnya dengan C. n. mantchuricus
• Rusa Sika Shanxi, C. n. grassianus, Shanxi, China
• Rusa Sika Ryukyu, C. n. keramae, Kepulauan Ryukyu
• Rusa Sika Cina Selatan, C. n. kopschi, China Selatan
• Rusa Sika Cina Utara, C. n. mandarinus, China Utara dan Timur Laut
• Rusa Sika Manchuria, C. n. mantchuricus, China Timur Laut dan Korea, adakalanya dikira sama subspesiesnya dengan C. n. dybowskii.
• Rusa Sika Jepun, C. n. nippon, terdapat di Honshu Selatan, Shikoku, dan Kyushu
• Rusa Sika Vietnam, C. n. pseudaxis, Vietnam Utara
• Rusa Sika Tsushima, C. n. pulchellus, Pulau Tsushima
• Rusa Sika Sichuan, C. n. sichuanicus, China Barat
• Rusa Sika Formosa, C. n. taioanus, Taiwan
• Rusa Sika Hokkaido, C. n. yesoensis, Hokkaido